ينقسم التدريب في مركز الحاسوب الحكومي إلى ثلاث أنواع :

1. تدريب الموظفين الحكوميين

يقوم المركز بتدريب الموظفين الحكوميين في مواضيع متخصصة ومتميزة يتم اختيارها بناءً على الاحتياجات التدريبية للوزارات والمؤسسات الحكومية وذلك على النحو التالي:

• تدريب متخصص للموظفين الحكوميين العاملين في قطاع تكنولوجيا المعلومات من مختلف الوزارات والمؤسسات الحكومية.
•  تدريب الموظفين على البرامج المكتبية المستخدمة في الوزارات والمؤسسات الحكومية.

2. تدريب خريجي هندسة الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات

يتم تدريب الخريجين في مركز الحاسوب الحكومي بثلاث طرق:

• المنح التدريبية لدورات متخصصة مثل منح برنامج أكاديمية سيسكو.
• احتضان مشاريع التخرج المتميزة والتي يمكن الاستفادة منها في الوزارات والمؤسسات الحكومية.
• التدريب الميداني في مجالات قطاع تكنولوجيا المعلومات التي يختص بها مركز الحاسوب الحكومي وهي: أمن المعلومات، الصيانة والدعم الفني، أنظمة تشغيل شبكات الحاسوب، برمجة وإدارة تطبيقات الويب، وبرمجة وإدارة قواعد البيانات.

3. تدريب طلبة هندسة الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات

يقوم مركز الحاسوب الحكومي باستقبال طلبة الجامعات والمعاهد الفلسطينية على مدار العام وتدريبهم بشكل عملي بأسلوب يحاكي الحياة العملية للعاملين في قطاع تكنولوجيا المعلومات بمختلف تخصصاتهم، وذلك ضمن برامج التدريب الصيفي والتدريب الميداني للطلبة.